慢性肾衰竭并不能治愈，故其治疗目标在于延缓肾衰竭的速度、减少并发症和控制征状。治疗慢性肾衰竭首先是要控制引致其慢性肾衰竭的根本问题，如
糖尿病、
高血压、肾炎等。病人须定期覆诊、严谨地依照医生于饮食、运动和服药的建议及指示，以控制病情。
饮食控制
遵从适当的饮食对慢性肾衰竭病人而言非常重要。控制蛋白质摄取份量，可保持肾功能，延缓肾衰竭的速度。病人也需要限制钾、磷、钠质及水分的摄取，亦须控制胆固醇的水平。病人需与医护人士及营养师商讨。
药物治疗
常用的药物包括:
- 降血压药: 如血管紧张素转化酶抑制剂 (Angiotensin-converting enzyme (ACE) inhibitors) 或血管紧张素II型受体阻滞剂 (Angiotensin II receptor blockers)以保护肾脏功能。
- 红血球生成素补充剂: 促进红血球生成以控制贫血。
- 维他命D:增加身体钙质的可用性和防止骨折。
- 磷酸盐结合剂: 以降低血中磷浓度。
肾脏替代治疗
当到达末期肾功能衰竭阶段(只余10至15%的正常肾功能时)，病人将不能有效排出体内的废物及过多水分，因而需要以辅助方法代替肾脏功能以维持生命，否则可引致死亡。
肾脏替代治疗包括：
- 透析治疗: 现时肾脏透析主要有两种，包括血液透析及腹膜透析。
i) 血液透析
血液透析（俗称洗血）是利用透析器把血液中之过多水分、电解物及废物等 排出，再将 经过过滤的血液引回体内。
病人首先需要接受植入动静脉瘘管或静脉导管。血液透析是由洗肾机处理，过程是由病人身体(经动静脉瘘管或静脉导管)每分钟抽出200cc 血液引流至透析机上的人工肾。血液在流过人工肾内附的半透膜时会被过滤，血液内的废物会被分开，净化后的血液会被输送回人体内。医生会因应病人需要决定血液透析治疗时间及频密度；病人通常会每星期进行2至3次血液透析，而每次约4至6小时。适合的病人亦可选于家中在晚上进行自我血液透析治疗。
优点: 快速有效，间歇性治疗每星期只需要接受2至3次透析。
缺点: 需要到洗肾中心接受血液透析，间歇性清理废物及水分，费用昂贵。
血液透析是长期性的治疗，病人须严谨地配合治疗方案并学习自我照顾的技巧。
提供血液透析的中心:
- 医院管理局的肾科中心 (给不适宜接受腹膜透析的病人)
- 医院管理局联同香港赛马会慈善信托基金及香港肾脏基金会提供「夜间家居血液透析」资助计划
- 慈善机构主辧的血液透析中心
- 私家医院的血液透析中心
ii) 腹膜透析
腹膜透析（俗称洗肚）利用腹膜上的微血管网络进行透析。
病人须接受腹膜透析导管植入，作为透析液出入腹腔的渠道。透析液经腹膜进行透析作用，排走病人体内的废物和过多水分。
家居腹膜透析分为以下两类：
- 连续性可携带腹膜透析 (Continuous Ambulatory Peritoneal Dialysis - CAPD)
在本港，约90%腹膜透析病人使用此法。
病人在家中进行此透析治疗。每天3至4次把透析液(洗肚水)经导管灌入腹腔内，透析液在腹腔内停留4至10小时后，把带有废物的透析液经导管放出体外为一次疗程。
优点: 连续性清理废物及水分，对心脏的负荷较低，在透析过程中仍可正常活动。
缺点: 每天需要换水3至4次，可引致腹膜炎，但在小心护理下可能性不高。
- 家居自动腹膜透析 (Automated Peritoneal Dialysis)
每晚夜在睡眠中接受腹膜透析。每晚睡前病人将喉管接驳到自动腹膜透析机，透析机会于10至12小时内，自动进行透析液更换。自动腹膜透析机会把适量的透析液灌入腹腔内，透析液在腹腔内停留一段时间后，透析机会自动把带有废物的透析液放出，再把新的透析液灌入腹腔内。
家居腹膜透析的好处是病人可自我护理，体内毒素及水分维持稳定，病人可维持正常社交及工作，但亦有感染等风险。病人须严谨地学习及执行自我护理的技巧。
iii) 肾脏移植
以外科手术将捐赠者的肾脏移植到肾衰竭患者体内。这可能是尸肾或活体(亲人)捐赠的肾脏。于2016年在香港接受肾脏移植者有78人(尸肾60人，活肾 18人)。正在轮候肾脏移植的人数大约有2000人。
肾脏移植手术是很成功的:
- 病人一年及五年生存率: 尸肾脏移–95%及89%，活肾脏移–96%及95%
- 移植肾脏一年及五年存活率: 尸肾脏移–92%及84%，活肾脏移–94%及89%
肾脏移植手术亦可能引致并发症，当中最为人关注的是「排斥」。病人手术后需服用多种药物，更有多种护理技巧需要留意。